Der Alligator wird auch als Durchflussmesssystem verwendet. Hierbei spielt die Selbstreinigung durch [[Alligator automatischer Spülstoss|Spülstoß]] eine große Rolle um den Wartungsaufwand zu verringern. Um sehr kleine Durchflüsse zu erfassen den Zyklusbetrieb. Er ist eine Ergänzung zur [[Low-Range Flow|Low-Range-Flow]] Kalibration. Viele Durchflussmessungen werden nach der Maximalmenge ausgelegt. Dabei wird die [[Spanne vom minimalen bis zum maximalen Durchfluss (Messdynamik)|Messdynamik]] strapaziert. Um auch bei kleinsten Mengen (Fremdwasser, Trockenwetter ...) eine Durchflussmessung sicherzustellen, gibt es beim [http://www.axel-zangenberg.de/loesungen/produkte/loesungen Alligator] die Zusatzfunktion Zyklusbetrieb. Bei Unterschreiten eines noch genau messbaren Durchflusses wird die Alligatorklappe geschlossen. Das System wartet jetzt solange, bis sich wieder genügend Wasser für eine genaue Messung gesammelt hat. Dann wird die Klappe wieder geöffnet. Der Zyklus beginnt von vorn.